More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  100 
 
 		 417 aa  828    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  70.67 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  57.52 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  58.31 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  58.1 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  58.1 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  58.19 
 
 		 410 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  58.1 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  56.28 
 
 		 410 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  50.47 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  48.48 
 
 		 464 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  48.33 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  44.16 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  38.99 
 
 		 417 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  37.47 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  40.25 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 		 419 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 		 408 aa  252  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  40.46 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 		 414 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  39.56 
 
 		 935 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  37.47 
 
 		 415 aa  239  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 		 414 aa  235  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  33 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  40.31 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  34.17 
 
 		 395 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 		 399 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 		 387 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 		 407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.81 
 
 		 388 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 		 379 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  28.57 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  27.54 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 537 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.36 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  30.19 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.65 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  27.78 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  32.54 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  30.27 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 672 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  28.94 
 
 		 404 aa  126  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  27.61 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 429 aa  123  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  30.02 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  31.82 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.64 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  29.78 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  25.42 
 
 		 650 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.35 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.33 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27.5 
 
 		 416 aa  116  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  30.22 
 
 		 384 aa  116  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 		 420 aa  116  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  31.04 
 
 		 396 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  28.2 
 
 		 398 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  29.95 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  27.85 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  30.75 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>