More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1130 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 403 aa  835    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 409 aa  488  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 410 aa  478  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 408 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 408 aa  441  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 415 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 414 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 413 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 413 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 415 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 426 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 410 aa  335  7.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 414 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 423 aa  332  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 417 aa  329  7e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 417 aa  328  8e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 419 aa  328  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  41.67 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 417 aa  326  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 446 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 423 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 414 aa  324  1e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 435 aa  322  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 416 aa  319  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 446 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 446 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 446 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 446 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 446 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 446 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1934  histidyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1606  histidyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0855028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 426 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 424 aa  315  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 426 aa  315  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 424 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 423 aa  312  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 442 aa  312  7.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 442 aa  312  7.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 450 aa  312  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 424 aa  311  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 429 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2376  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 433 aa  309  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>