245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2968 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  81.86 
 
 		 442 aa  670    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  846    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  50.11 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  49.11 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  48.31 
 
 		 434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  47.51 
 
 		 436 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  51.24 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  48.55 
 
 		 444 aa  349  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  48.53 
 
 		 456 aa  345  8.999999999999999e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  44.77 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 440 aa  339  7e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  47.02 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  48.76 
 
 		 408 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  48.66 
 
 		 444 aa  299  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 457 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  37.31 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  48.76 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  42.71 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  28.46 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  28.46 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2100  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  25.16 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.52 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  27.52 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.98 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  28.35 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  26.61 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  25.69 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  25.69 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.95 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  29.48 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.91 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.97 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.62 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.95 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.62 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  28.39 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.62 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  22.15 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  28.24 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.77 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  29.21 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  27.48 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  21.45 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  27.48 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  27.48 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  27.48 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  27.48 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  31.34 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  31.34 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  28.4 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  31.34 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  31.34 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  27.48 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.27 
 
 		 688 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  27.74 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.84 
 
 		 686 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.54 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  31.34 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  21.32 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  24.05 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  24.19 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  19.65 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  19.65 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2633  putative permease  27.48 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.778605  hitchhiker  0.00000416081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  26.72 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>