More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0636 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 478 aa  948    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.16 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.06 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  45.18 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  44.54 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 479 aa  316  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  42.69 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 461 aa  297  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 470 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 470 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.27 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.45 
 
 		 468 aa  219  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  29.47 
 
 		 493 aa  171  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.09 
 
 		 484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 477 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 478 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  25.78 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.31 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.72 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.31 
 
 		 483 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.25 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 477 aa  157  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 473 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  26.35 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  26.54 
 
 		 485 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.41 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.1 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.1 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  26.88 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.62 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  27.11 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.42 
 
 		 477 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.99 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.11 
 
 		 477 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 489 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 475 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.11 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  25.21 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 430 aa  152  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 477 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  25.57 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 469 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  23.96 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 479 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 547 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  27.16 
 
 		 469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.43 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 474 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 474 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  26.93 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  30.67 
 
 		 398 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.11 
 
 		 483 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  24.74 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  25.49 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 496 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.07 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.73 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 398 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  27.79 
 
 		 554 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>