More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0256 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  87.68 
 
 
949 aa  1468    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  53.14 
 
 
866 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  51.31 
 
 
968 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.62 
 
 
944 aa  792    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  47 
 
 
814 aa  636    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  49.73 
 
 
897 aa  753    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  46.8 
 
 
1010 aa  694    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0256  ABC transporter related  100 
 
 
948 aa  1846    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  52.13 
 
 
976 aa  759    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  56.65 
 
 
868 aa  878    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  53.15 
 
 
876 aa  743    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
302 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 
331 aa  205  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.2 
 
 
331 aa  205  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  42.2 
 
 
331 aa  205  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  42.2 
 
 
303 aa  204  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  44.23 
 
 
326 aa  204  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  42.2 
 
 
303 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  41.84 
 
 
303 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  42.2 
 
 
303 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3425  ABC transporter related protein  45.54 
 
 
340 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458573  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  40.78 
 
 
303 aa  201  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
311 aa  200  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  37.75 
 
 
320 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  41.98 
 
 
300 aa  197  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.76 
 
 
329 aa  194  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
310 aa  193  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  43.43 
 
 
342 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  39.22 
 
 
305 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
304 aa  191  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  39.47 
 
 
457 aa  190  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  42.96 
 
 
318 aa  189  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
306 aa  189  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
301 aa  189  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  39.06 
 
 
301 aa  188  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  43.09 
 
 
351 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  46.36 
 
 
326 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  44.11 
 
 
310 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.6 
 
 
341 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 
305 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
346 aa  184  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
305 aa  183  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  36.49 
 
 
305 aa  183  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  41.96 
 
 
304 aa  183  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 
300 aa  182  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 
300 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
305 aa  181  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  42.86 
 
 
302 aa  181  8e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  35.12 
 
 
302 aa  180  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  39.88 
 
 
347 aa  180  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 
300 aa  180  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.15 
 
 
305 aa  179  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  40.91 
 
 
304 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 
300 aa  179  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  36.75 
 
 
300 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 
300 aa  179  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
305 aa  178  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  38.03 
 
 
300 aa  178  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
305 aa  178  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 
305 aa  178  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  47.64 
 
 
322 aa  177  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 
305 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 
300 aa  177  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 
300 aa  177  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  36.68 
 
 
307 aa  177  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 
300 aa  177  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 
305 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 
305 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.37 
 
 
300 aa  177  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4839  ABC transporter related protein  40.47 
 
 
322 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.34 
 
 
368 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  40.71 
 
 
389 aa  175  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  31.08 
 
 
494 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  40.53 
 
 
300 aa  173  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.25 
 
 
318 aa  172  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  35.92 
 
 
318 aa  172  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.67 
 
 
299 aa  172  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  36.33 
 
 
304 aa  171  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
319 aa  170  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  33.33 
 
 
303 aa  171  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  36.3 
 
 
307 aa  170  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  36.24 
 
 
297 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
234 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.15 
 
 
324 aa  169  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  34.98 
 
 
316 aa  169  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  39.4 
 
 
330 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  42.76 
 
 
323 aa  168  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  35.48 
 
 
299 aa  168  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 
307 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
305 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1376  ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 
268 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0958944  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  39.08 
 
 
323 aa  167  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  37.34 
 
 
327 aa  167  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  40.33 
 
 
318 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  38.71 
 
 
311 aa  165  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  36.68 
 
 
309 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  37.07 
 
 
315 aa  165  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  44.98 
 
 
409 aa  164  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
309 aa  164  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4755  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 
242 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>