54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2972 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  100 
 
 		 184 aa  360  6e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  34.59 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  31.52 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  24.87 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  30 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  34.07 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.62 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  34.31 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  29.51 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  26.53 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.68 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  31.91 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  30.94 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  33.12 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  28.21 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  28.72 
 
 		 272 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  28.72 
 
 		 272 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  36.59 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  27.53 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  27.08 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0944  hypothetical protein  36.47 
 
 		 265 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  28.46 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  28.46 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.74 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  30.95 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  31.33 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  36.9 
 
 		 149 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  27.01 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  24.08 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  29.03 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  29.68 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  25.85 
 
 		 227 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  26.22 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  26.2 
 
 		 267 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  28.68 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  26.22 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  26.22 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  26.22 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  26.22 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  23.81 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  26.22 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  26.22 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  27.7 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  26.22 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  25.4 
 
 		 151 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  26.22 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  32.26 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  26.09 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  29.8 
 
 		 258 aa  41.2  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>