More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1264 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  100 
 
 
600 aa  1218    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  66.84 
 
 
600 aa  865    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  48.1 
 
 
604 aa  573  1.0000000000000001e-162  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  47.22 
 
 
592 aa  568  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  47.68 
 
 
601 aa  567  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  46.91 
 
 
590 aa  561  1e-158  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  46.39 
 
 
590 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  46.39 
 
 
590 aa  551  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  47.65 
 
 
590 aa  549  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  46.54 
 
 
590 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  46.32 
 
 
590 aa  547  1e-154  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
586 aa  544  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  46.58 
 
 
589 aa  538  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  46.05 
 
 
589 aa  532  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  45.96 
 
 
588 aa  531  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  44.35 
 
 
590 aa  530  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
604 aa  527  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  44.21 
 
 
606 aa  525  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  43.84 
 
 
590 aa  524  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  43.07 
 
 
589 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  43.41 
 
 
623 aa  512  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
604 aa  508  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  42.57 
 
 
610 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  43.84 
 
 
589 aa  504  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  42.13 
 
 
609 aa  505  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  42.76 
 
 
611 aa  501  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  42.76 
 
 
611 aa  501  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0894318 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  43.12 
 
 
603 aa  497  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  43 
 
 
588 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  43 
 
 
600 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  42.33 
 
 
595 aa  479  1e-134  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  42.83 
 
 
584 aa  481  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  42.51 
 
 
564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  26.19 
 
 
489 aa  121  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7123  ABC transporter related  25.1 
 
 
629 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333209  normal  0.399658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  27.67 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  25.84 
 
 
572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  26.44 
 
 
522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  23.97 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  24.74 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5970  ABC transporter related  25.29 
 
 
631 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  27.17 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.38 
 
 
613 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  24.9 
 
 
557 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  23.96 
 
 
539 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  26.3 
 
 
543 aa  107  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.59 
 
 
555 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  26.68 
 
 
555 aa  107  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  24.21 
 
 
659 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28594  normal  0.0160708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 
556 aa  105  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.81 
 
 
555 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.81 
 
 
555 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.72 
 
 
555 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  26.48 
 
 
514 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  24.44 
 
 
539 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  26.07 
 
 
514 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1433  ABC transporter related protein  27.01 
 
 
649 aa  103  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.85 
 
 
555 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  25.57 
 
 
482 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  25.99 
 
 
514 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  25.37 
 
 
495 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.55 
 
 
553 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.84 
 
 
556 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.57 
 
 
490 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.15 
 
 
553 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  25.46 
 
 
514 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  25.15 
 
 
582 aa  101  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.43 
 
 
553 aa  101  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (dipeptide)  25.94 
 
 
555 aa  101  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.8 
 
 
564 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.42 
 
 
556 aa  100  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.98 
 
 
555 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  24.69 
 
 
551 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  22.98 
 
 
543 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  23.33 
 
 
634 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.49 
 
 
555 aa  100  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1296  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.54 
 
 
555 aa  100  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341182  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  23.97 
 
 
555 aa  100  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  24.38 
 
 
641 aa  100  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  24.57 
 
 
648 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0571  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.66 
 
 
554 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  24.2 
 
 
622 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  24.57 
 
 
543 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  26.04 
 
 
491 aa  99.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  23.87 
 
 
636 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.59 
 
 
557 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19880  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  25.51 
 
 
551 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00329982  hitchhiker  0.000556762 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1137  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.66 
 
 
560 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000210355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  25.7 
 
 
517 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  24.95 
 
 
613 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  26.73 
 
 
564 aa  99.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3221  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.21 
 
 
589 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  23.6 
 
 
614 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0036  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.9 
 
 
555 aa  98.6  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0037  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.9 
 
 
555 aa  98.6  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264543  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  26.61 
 
 
613 aa  98.2  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  26.87 
 
 
518 aa  98.2  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.74 
 
 
705 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.63 
 
 
553 aa  97.8  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.95 
 
 
595 aa  97.8  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>