More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1963 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  58.91 
 
 		 586 aa  723    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  83.51 
 
 		 576 aa  1024    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 576 aa  1189    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  39.9 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 		 596 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  38.58 
 
 		 574 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  39.25 
 
 		 596 aa  445  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  39.9 
 
 		 606 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  38.09 
 
 		 577 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  38.13 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 		 569 aa  425  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 		 571 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  37.21 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  37.75 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 		 621 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 		 574 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 		 585 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  36.65 
 
 		 579 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 		 589 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  35.24 
 
 		 574 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  33.79 
 
 		 590 aa  363  5.0000000000000005e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 		 570 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 		 610 aa  350  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  34.49 
 
 		 591 aa  333  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 548 aa  269  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 		 605 aa  263  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  31.77 
 
 		 562 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  30.21 
 
 		 565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  29.38 
 
 		 571 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  30.22 
 
 		 595 aa  252  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  31.35 
 
 		 554 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  29.71 
 
 		 555 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 		 556 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 573 aa  244  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  31.52 
 
 		 555 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  30.57 
 
 		 529 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  29.9 
 
 		 594 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  30.74 
 
 		 556 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  31.48 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  30.56 
 
 		 556 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  32.41 
 
 		 533 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  30.74 
 
 		 559 aa  237  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  29.11 
 
 		 556 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 566 aa  231  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  28.52 
 
 		 563 aa  230  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  29.04 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  29.82 
 
 		 580 aa  219  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  23.36 
 
 		 700 aa  160  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  23.69 
 
 		 667 aa  158  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  29.08 
 
 		 705 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 666 aa  133  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.18 
 
 		 666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  29.6 
 
 		 662 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.01 
 
 		 614 aa  124  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 		 625 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.86 
 
 		 668 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  27.47 
 
 		 634 aa  117  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.89 
 
 		 707 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 		 469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  27.52 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 710 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 419 aa  110  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.55 
 
 		 653 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 		 776 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.38 
 
 		 627 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 		 651 aa  108  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  28.52 
 
 		 666 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  28.52 
 
 		 664 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  28.52 
 
 		 664 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 		 502 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.29 
 
 		 594 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.54 
 
 		 625 aa  107  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.68 
 
 		 598 aa  107  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  26.01 
 
 		 457 aa  107  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.47 
 
 		 641 aa  106  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.34 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 328 aa  106  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 673 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 612 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  24.54 
 
 		 325 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 1479 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 598 aa  103  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.61 
 
 		 825 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 		 479 aa  103  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.92 
 
 		 1044 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  27.89 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 		 479 aa  103  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  27.01 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 1435 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  28.23 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>