More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8229 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 
342 aa  701    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  84.75 
 
 
340 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.36 
 
 
344 aa  558  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.67 
 
 
331 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.76 
 
 
333 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.05 
 
 
363 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.62 
 
 
329 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.25 
 
 
330 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.03 
 
 
321 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.73 
 
 
324 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.58 
 
 
328 aa  411  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.03 
 
 
324 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.12 
 
 
325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.39 
 
 
322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.79 
 
 
323 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.49 
 
 
326 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.66 
 
 
334 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 
327 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.26 
 
 
327 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.1 
 
 
327 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.26 
 
 
338 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.05 
 
 
360 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.55 
 
 
380 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
358 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
362 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 
359 aa  362  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.62 
 
 
362 aa  361  8e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.34 
 
 
343 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.34 
 
 
343 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.82 
 
 
368 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.34 
 
 
339 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.34 
 
 
339 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.92 
 
 
368 aa  359  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.18 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.95 
 
 
329 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.59 
 
 
342 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.95 
 
 
328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.8 
 
 
348 aa  352  4e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  51.8 
 
 
348 aa  352  4e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.49 
 
 
328 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.58 
 
 
345 aa  352  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.7 
 
 
350 aa  351  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.57 
 
 
361 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.45 
 
 
328 aa  347  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
344 aa  347  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.75 
 
 
340 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.57 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
344 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.45 
 
 
348 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.81 
 
 
332 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0229632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.43 
 
 
349 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.16 
 
 
348 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  52.03 
 
 
340 aa  339  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.16 
 
 
348 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.16 
 
 
348 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.76 
 
 
350 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50 
 
 
346 aa  338  8e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  49.28 
 
 
373 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.89 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0757  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.87 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.14 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
368 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.87 
 
 
348 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  52.01 
 
 
361 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.87 
 
 
348 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.18 
 
 
347 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.18 
 
 
347 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.18 
 
 
347 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.43 
 
 
361 aa  335  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.18 
 
 
347 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0759  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
346 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.12 
 
 
323 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.18 
 
 
347 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.89 
 
 
347 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
373 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
373 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.89 
 
 
347 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.57 
 
 
367 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.96 
 
 
335 aa  333  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.16 
 
 
347 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  49.57 
 
 
355 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.65 
 
 
340 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.72 
 
 
360 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.57 
 
 
364 aa  333  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.75 
 
 
373 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.71 
 
 
363 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.32 
 
 
323 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
346 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  48.2 
 
 
367 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.17 
 
 
342 aa  331  9e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.14 
 
 
362 aa  331  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.57 
 
 
346 aa  331  9e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.86 
 
 
363 aa  330  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.05 
 
 
340 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.57 
 
 
362 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
343 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2117  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  50.27 
 
 
374 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.579852  normal  0.77541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  47.91 
 
 
357 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>