More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6102 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  76.67 
 
 		 418 aa  639    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  100 
 
 		 421 aa  844    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 420 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  65.79 
 
 		 421 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  63.37 
 
 		 420 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 421 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 420 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 421 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3356  histidyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00613181  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 418 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 418 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 418 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 421 aa  353  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  47.75 
 
 		 423 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 417 aa  349  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 441 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 421 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 420 aa  342  7e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 419 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 415 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 418 aa  339  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 423 aa  338  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 422 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 445 aa  336  5e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  48.26 
 
 		 424 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 413 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 422 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.11 
 
 		 422 aa  333  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 426 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 422 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 420 aa  329  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 420 aa  329  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 447 aa  329  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 430 aa  328  7e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 414 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  45.63 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 420 aa  325  7e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 424 aa  325  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>