More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5455 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  875    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4653  hypothetical protein  47.76 
 
 		 371 aa  239  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.465095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  44.99 
 
 		 372 aa  216  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 		 507 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  26.51 
 
 		 487 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  25.21 
 
 		 487 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  25.42 
 
 		 559 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  26.67 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  23.29 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  25.1 
 
 		 487 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 459 aa  143  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  25.42 
 
 		 487 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  25.1 
 
 		 559 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  25.47 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  25.42 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  33.47 
 
 		 4575 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 509 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  24.8 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  19.96 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  19.96 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  33.26 
 
 		 6768 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  33.81 
 
 		 4930 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 5154 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  27.18 
 
 		 504 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  29.69 
 
 		 2374 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  25.76 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 		 508 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2232  amino acid adenylation domain protein  31.91 
 
 		 1395 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.214627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  26.84 
 
 		 605 aa  106  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 494 aa  106  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  28.61 
 
 		 509 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  29.55 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0910  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 501 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  28.08 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 521 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0520634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 497 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 502 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2102  AMP-dependent synthetase and ligase  26.84 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0103698  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  26.26 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.72 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  27.55 
 
 		 536 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  28.78 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  28.9 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.94 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2860  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 535 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43217  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.69 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 508 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 1103 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 		 508 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 531 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.19 
 
 		 492 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4589  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.07 
 
 		 538 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.335072  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  27.92 
 
 		 509 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  28.49 
 
 		 530 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  28.37 
 
 		 510 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  22.91 
 
 		 474 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 		 511 aa  99.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  27.83 
 
 		 526 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 502 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.15 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 		 575 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  25.96 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 		 571 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  26.36 
 
 		 504 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  28.74 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.57 
 
 		 547 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  27.4 
 
 		 539 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.08 
 
 		 482 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  25.79 
 
 		 525 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2629  rfbL protein  23.11 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  26.69 
 
 		 547 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.7 
 
 		 482 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.7 
 
 		 481 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 521 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 		 566 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3821  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 473 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3895  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 473 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>