More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3344 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3344  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  100 
 
 		 925 aa  1804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0408204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6839  acyl-CoA synthetase  60.69 
 
 		 503 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189698  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2202  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  56.55 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5071  AMP-dependent synthetase and ligase  54 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2579  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 503 aa  237  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.8 
 
 		 531 aa  217  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  34.73 
 
 		 510 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 511 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 587 aa  209  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 525 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 530 aa  204  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 		 662 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 520 aa  202  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 532 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  30.68 
 
 		 504 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 540 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 		 570 aa  198  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.8 
 
 		 525 aa  197  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  32.48 
 
 		 513 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3218  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 495 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 520 aa  195  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 551 aa  194  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 		 531 aa  193  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 630 aa  193  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.88 
 
 		 530 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 525 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 528 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 511 aa  192  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  32.53 
 
 		 516 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  31.14 
 
 		 522 aa  191  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 512 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  31.72 
 
 		 529 aa  191  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 509 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 521 aa  189  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 530 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 570 aa  189  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  32.41 
 
 		 534 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 770 aa  188  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  27.66 
 
 		 499 aa  188  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  33.93 
 
 		 487 aa  188  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 511 aa  188  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0519  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 564 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  28.12 
 
 		 500 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 502 aa  187  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.92 
 
 		 579 aa  187  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 499 aa  187  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 		 526 aa  187  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  31.29 
 
 		 533 aa  187  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  28.32 
 
 		 500 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  28.12 
 
 		 500 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  28.32 
 
 		 500 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 521 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 516 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.88 
 
 		 556 aa  185  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.88 
 
 		 556 aa  185  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.16 
 
 		 519 aa  185  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.88 
 
 		 556 aa  185  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 511 aa  185  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 521 aa  185  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.57 
 
 		 514 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 515 aa  184  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.92 
 
 		 554 aa  184  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 514 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 500 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 524 aa  183  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.17 
 
 		 497 aa  183  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 514 aa  183  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1180  hypothetical protein  27.59 
 
 		 544 aa  183  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 509 aa  183  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 524 aa  182  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  33.54 
 
 		 492 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28 
 
 		 500 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 502 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 551 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 545 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 502 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.03 
 
 		 552 aa  181  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0286  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 530 aa  182  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  28 
 
 		 500 aa  181  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 532 aa  181  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 508 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 		 509 aa  181  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  29.19 
 
 		 601 aa  181  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 591 aa  181  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  30.11 
 
 		 503 aa  180  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.31 
 
 		 525 aa  180  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 508 aa  180  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.51 
 
 		 512 aa  180  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 557 aa  180  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 520 aa  179  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 512 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.75 
 
 		 503 aa  179  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1028  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0219794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  30.36 
 
 		 522 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>