More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1992 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 524 aa  1039    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.933097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal  0.503326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  32.33 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 532 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  31.12 
 
 		 520 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 525 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.96 
 
 		 514 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.86 
 
 		 579 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.66 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.71 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  28.9 
 
 		 529 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.04 
 
 		 512 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  31.45 
 
 		 529 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  29.92 
 
 		 522 aa  177  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 506 aa  177  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 520 aa  177  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 520 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 499 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 521 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.01 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.76 
 
 		 513 aa  174  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  30.13 
 
 		 513 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 508 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.79 
 
 		 524 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 520 aa  173  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 534 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1913  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 536 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 515 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 512 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.08 
 
 		 556 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.08 
 
 		 556 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.08 
 
 		 556 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  29.8 
 
 		 537 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 501 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  29.8 
 
 		 537 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  29.8 
 
 		 537 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3198  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.179395  normal  0.194105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 1043 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 530 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 564 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 546 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 546 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 546 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 546 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0286  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 530 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  28.95 
 
 		 546 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 540 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 		 511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  31.42 
 
 		 522 aa  166  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.14 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 515 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  26.11 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.8 
 
 		 570 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4908  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.96823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 		 528 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 510 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 561 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 534 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.49 
 
 		 518 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 544 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 554 aa  163  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 495 aa  163  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.32 
 
 		 525 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 551 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 520 aa  163  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.89 
 
 		 518 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  26.11 
 
 		 500 aa  163  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 521 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  29.33 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.69 
 
 		 518 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.8 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  25.97 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.76 
 
 		 517 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.76 
 
 		 517 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.76 
 
 		 517 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 559 aa  162  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 515 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 562 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  26.16 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  26.16 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.22 
 
 		 565 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  27.55 
 
 		 527 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.05 
 
 		 503 aa  160  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 506 aa  160  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  29.75 
 
 		 555 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>