43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1847 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  100 
 
 
877 aa  1730    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4360  Phage-related minor tail protein-like  30.59 
 
 
1206 aa  153  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348966  normal  0.27157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  30.19 
 
 
1660 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3484  putative tail protein from prophage; putative tail length tape measure motif protein  26.96 
 
 
409 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0174075  hitchhiker  0.00423679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3196  phage tail tape measure protein, TP901 family  26.9 
 
 
959 aa  111  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.112717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2660  phage tail tape measure protein, TP901 family  24.95 
 
 
1032 aa  110  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1215  TP901 family phage tail tape measure protein  26.33 
 
 
1030 aa  101  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  26.92 
 
 
1137 aa  90.9  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  24.36 
 
 
1155 aa  74.3  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  24.36 
 
 
1155 aa  74.3  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  39.42 
 
 
1136 aa  65.9  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  39.42 
 
 
1136 aa  65.9  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  30.37 
 
 
956 aa  63.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  20.65 
 
 
767 aa  62.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1952  hypothetical protein  34.65 
 
 
697 aa  61.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  23.04 
 
 
1297 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2586  TP901 family phage tail tape measure protein  25 
 
 
1346 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  24.64 
 
 
969 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  25.13 
 
 
874 aa  56.6  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  22 
 
 
807 aa  53.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  23.01 
 
 
786 aa  53.5  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  23.26 
 
 
871 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  24.52 
 
 
759 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  28 
 
 
959 aa  51.2  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  22.19 
 
 
811 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  22.19 
 
 
811 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2632  phage tail tape measure protein, family  22.92 
 
 
1283 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  21.59 
 
 
1077 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  29.82 
 
 
993 aa  48.9  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  22.09 
 
 
725 aa  48.9  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37360  Phage TMP domain-containing protein  25.37 
 
 
1078 aa  48.5  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  23.41 
 
 
887 aa  47.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  23.68 
 
 
759 aa  47.8  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  19.23 
 
 
1510 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  19.23 
 
 
1510 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  24.54 
 
 
716 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3248  hypothetical protein  38.71 
 
 
318 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483531  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  27.78 
 
 
1084 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  22.33 
 
 
726 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  28.57 
 
 
693 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  19.18 
 
 
911 aa  45.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  20.28 
 
 
792 aa  44.7  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1327  phage-related tail transmembrane protein  30.21 
 
 
986 aa  44.3  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>