97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0913 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  79.25 
 
 		 424 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  100 
 
 		 429 aa  864    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  65.28 
 
 		 412 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  62.76 
 
 		 418 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  62.53 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  54 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  53.67 
 
 		 415 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  54.67 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  47.03 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  46.53 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  43.75 
 
 		 412 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  46.73 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  42.65 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  41.87 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  42.54 
 
 		 408 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  42.54 
 
 		 408 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  42.54 
 
 		 408 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  43.39 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  43.5 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  41.65 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  43.42 
 
 		 406 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  30.72 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  30.72 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  31.07 
 
 		 445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  31.45 
 
 		 462 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.35 
 
 		 455 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  31.02 
 
 		 445 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  33.25 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  28.19 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  29.44 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.44 
 
 		 449 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  35.64 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  29.62 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  27.81 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  29.17 
 
 		 445 aa  169  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  27.81 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  28.73 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  28.73 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  30.62 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  28.48 
 
 		 447 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  32 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.41 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  33.77 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  25.65 
 
 		 443 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  26.71 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  30.96 
 
 		 491 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  26.58 
 
 		 446 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  32.27 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  27.72 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.15 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  27.98 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  25.61 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  28.85 
 
 		 474 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  30.96 
 
 		 476 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.01 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  30.35 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  26.27 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  29.25 
 
 		 507 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  29.34 
 
 		 744 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  29.66 
 
 		 472 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  31.77 
 
 		 456 aa  116  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  28.73 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  25.28 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  29.19 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  23.89 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  39.16 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2195  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  24.02 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0493  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  32.62 
 
 		 460 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2457  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  24.17 
 
 		 494 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09480  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  27.32 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0452016  normal  0.0351394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3631  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  27.46 
 
 		 453 aa  46.6  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1685  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.88 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2192  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  28.15 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1335  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  29.46 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2192  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1408  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.92 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0738105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12188  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  33.9 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000211725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0690  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255156  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2596  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.75 
 
 		 470 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1572  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  30.33 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.795321 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2431  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  33.04 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5098  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31.34 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2989  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  32.14 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0256473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2856  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.75 
 
 		 470 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4635  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31.34 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0173708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0779  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31.13 
 
 		 465 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230521  normal  0.687569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2409  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  30.86 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.125264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2103  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31.13 
 
 		 465 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3016  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  26.62 
 
 		 529 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3669  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.24 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00445508  normal  0.10958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2153  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  22.58 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.136521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0690  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31.13 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1049  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31.85 
 
 		 466 aa  43.5  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3766  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  31.82 
 
 		 504 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257898  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.87 
 
 		 489 aa  43.1  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2084  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.22 
 
 		 463 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0517095  decreased coverage  0.000454332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>