79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1475 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  100 
 
 
335 aa  692    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  35.87 
 
 
354 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2876  hydrolase family protein  38.29 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4281  hydrolase family protein  39.03 
 
 
332 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.549804  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  33.46 
 
 
339 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6139  hypothetical protein  32.37 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728188  normal  0.412726 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5774  hypothetical protein  32.37 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.471625  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  32.78 
 
 
334 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  29.93 
 
 
474 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  28.7 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.57 
 
 
477 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.015622  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  30.46 
 
 
580 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  30.94 
 
 
258 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  26.22 
 
 
498 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  24.44 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  24.33 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  24.07 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  24.44 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  25.46 
 
 
496 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  24.07 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  33.06 
 
 
281 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  23.1 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  24.07 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0117  esterase/lipase  26.05 
 
 
570 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  24.07 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  22.39 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  24.84 
 
 
229 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  28.78 
 
 
473 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  24.89 
 
 
465 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  24.22 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  29.5 
 
 
490 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  23.79 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0498  hypothetical protein  28.52 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.05 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  23.53 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
256 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  42.47 
 
 
277 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  29.27 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  26.36 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  28.47 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4783  hypothetical protein  29.79 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.274581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.43 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  20.49 
 
 
518 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.59 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  28.72 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  23.57 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  30.77 
 
 
305 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.97 
 
 
656 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.5 
 
 
650 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  26.36 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  29.13 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  26.21 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4242  hypothetical protein  44.44 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328451 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  21.08 
 
 
259 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  25 
 
 
402 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  25.52 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  20.15 
 
 
261 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  22.6 
 
 
219 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  27.66 
 
 
215 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  27.66 
 
 
215 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  27.66 
 
 
215 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  22.62 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3975  hypothetical protein  23.21 
 
 
218 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.827337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4343  hypothetical protein  23.21 
 
 
218 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.519854  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  27.66 
 
 
215 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.69 
 
 
644 aa  42.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  22.14 
 
 
254 aa  42.7  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4455  conserved hypothetical protein; putative alpha/beta hydrolase domain  23.21 
 
 
218 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136378  normal  0.0686952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>