47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0836 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 403 aa  835    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  59.15 
 
 		 402 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  62.01 
 
 		 388 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  57.54 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  52.82 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  52.23 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  51.06 
 
 		 395 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  49.74 
 
 		 395 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  51.58 
 
 		 376 aa  398  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  50.8 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  51.06 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  48.54 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  46.87 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  48.28 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  46.37 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  31.25 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  30.97 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  35.89 
 
 		 392 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 380 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  29.02 
 
 		 386 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  30.29 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.56 
 
 		 639 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  31.33 
 
 		 725 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 643 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 		 1507 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 718 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 878 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 632 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 602 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.87 
 
 		 579 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 827 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  25.77 
 
 		 743 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2768  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 187 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 		 571 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 934 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 		 577 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 767 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2218  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 842 aa  43.9  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.000600865  normal  0.100568 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 265 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 653 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  26.38 
 
 		 653 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>