54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0671 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  100 
 
 
383 aa  779    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  78.18 
 
 
384 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  78.39 
 
 
382 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  79.37 
 
 
381 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  71.43 
 
 
387 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  70.65 
 
 
387 aa  531  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0937  putative lipoprotein  70.94 
 
 
386 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000801975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0971  putative lipoprotein  70.94 
 
 
386 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0240965  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  63.32 
 
 
381 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  29.34 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  31.75 
 
 
425 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  28.74 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1934  hypothetical protein  28.2 
 
 
368 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0548586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  25.42 
 
 
410 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  26.98 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  25.5 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  26.5 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0310  hypothetical protein  21.89 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  23.33 
 
 
431 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0825  hypothetical protein  23.47 
 
 
358 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  25.9 
 
 
399 aa  62.8  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  29.6 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  24.18 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  22.89 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  24.29 
 
 
378 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  22.89 
 
 
422 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  21.67 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  24.26 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08516  hypothetical protein  28.14 
 
 
379 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  24.15 
 
 
372 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  25.16 
 
 
420 aa  56.2  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  25.15 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  21.39 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  22.01 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  21.32 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  30.48 
 
 
417 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  24.94 
 
 
441 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  21.75 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  21.32 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  21.11 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  24.66 
 
 
374 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  22.32 
 
 
338 aa  46.6  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  21.12 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  21.49 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  27.94 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  28.15 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  21.9 
 
 
475 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  28.36 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  20.28 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  22.66 
 
 
458 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  21.73 
 
 
424 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  22.61 
 
 
435 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  20.16 
 
 
353 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  27.21 
 
 
445 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>