144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6313 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6313  Phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
404 aa  797    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3828  phosphatidylserine decarboxylase related protein  56.69 
 
 
417 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458299  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4218  phosphatidylserine decarboxylase related protein  56.97 
 
 
418 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  47.16 
 
 
232 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1908  phosphatidylserine decarboxylase  42.53 
 
 
214 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  40.8 
 
 
219 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  35.11 
 
 
232 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4178  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.21 
 
 
229 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.79 
 
 
205 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  42.77 
 
 
220 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  41.04 
 
 
232 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.54 
 
 
221 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.54 
 
 
221 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  42.2 
 
 
232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  38.3 
 
 
219 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  34.67 
 
 
218 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  37.77 
 
 
219 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4863  phosphatidylserine decarboxylase  36.32 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.619442  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  39.46 
 
 
208 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  40.7 
 
 
214 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  39.43 
 
 
217 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  42.35 
 
 
232 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  35.37 
 
 
231 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.11 
 
 
232 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  39.78 
 
 
214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  39.78 
 
 
214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  40.32 
 
 
214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  39.78 
 
 
214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  39.78 
 
 
214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  40.32 
 
 
214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  39.25 
 
 
217 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3717  phosphatidylserine decarboxylase  40.46 
 
 
213 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00382056  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  34.62 
 
 
215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  39.78 
 
 
214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1894  phosphatidylserine decarboxylase  42.21 
 
 
217 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.542259  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0288  phosphatidylserine decarboxylase-related  38.82 
 
 
212 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  42.77 
 
 
225 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  40.57 
 
 
232 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  39.43 
 
 
232 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.54 
 
 
218 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  34.86 
 
 
230 aa  108  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  41.34 
 
 
232 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  40.52 
 
 
194 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10442  phosphatidylserine decarboxylase  40.23 
 
 
231 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.664785  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  37.31 
 
 
218 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2360  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  38.59 
 
 
221 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  35.33 
 
 
208 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 
257 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  38.37 
 
 
213 aa  106  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  39.76 
 
 
215 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  32.85 
 
 
218 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  42.44 
 
 
215 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  39.25 
 
 
216 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.78 
 
 
232 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  39.88 
 
 
232 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  33.65 
 
 
213 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  39.25 
 
 
216 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  39.25 
 
 
216 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  39.25 
 
 
216 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  39.18 
 
 
225 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  41.28 
 
 
214 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  38.89 
 
 
247 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  36.56 
 
 
262 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.89 
 
 
237 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  38.71 
 
 
216 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  38.71 
 
 
216 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  38.71 
 
 
224 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  38.71 
 
 
216 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.12 
 
 
233 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  35.59 
 
 
224 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  37.64 
 
 
252 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6049  Phosphatidylserine decarboxylase  39.88 
 
 
215 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.89 
 
 
237 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  38.42 
 
 
248 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  35.26 
 
 
212 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  35.84 
 
 
212 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  35.33 
 
 
232 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  38.17 
 
 
212 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0594  phosphatidylserine decarboxylase  39.66 
 
 
252 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  35.33 
 
 
232 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  34.41 
 
 
232 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  40.13 
 
 
215 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0607  phosphatidylserine decarboxylase  39.66 
 
 
235 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0585  phosphatidylserine decarboxylase  39.66 
 
 
235 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.51 
 
 
219 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  36.76 
 
 
225 aa  100  5e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  39.18 
 
 
233 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  38.17 
 
 
212 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  32.95 
 
 
213 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  34.74 
 
 
212 aa  99.8  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2825  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.12 
 
 
222 aa  99.4  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.33 
 
 
237 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  39.47 
 
 
215 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.42 
 
 
236 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  37.63 
 
 
212 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0875  phosphatidylserine decarboxylase  31.95 
 
 
203 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07916  putative phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  37.79 
 
 
216 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.75 
 
 
236 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  38.6 
 
 
226 aa  96.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.75 
 
 
236 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>