109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6243 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
335 aa  680    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.59 
 
 
352 aa  315  7e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.19 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  44.87 
 
 
331 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.98 
 
 
330 aa  225  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.61 
 
 
344 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.4 
 
 
330 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  36.31 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  36.02 
 
 
340 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  36.02 
 
 
340 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
346 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  35.73 
 
 
341 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  35.73 
 
 
340 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  39.47 
 
 
331 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.87 
 
 
345 aa  205  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  35.73 
 
 
341 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  35.45 
 
 
345 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  36.31 
 
 
345 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  38.53 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.06 
 
 
328 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
320 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 
316 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  34.32 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.14 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
328 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  31.36 
 
 
330 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
330 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.71 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  25.41 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  25.41 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  28.16 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  22.06 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  26.74 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  24.48 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  25.64 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.22 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
310 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
300 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  24.6 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  23.55 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  23.81 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  25.91 
 
 
292 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  23.67 
 
 
307 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  25.91 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  25.58 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  25.91 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  27.89 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  27.24 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  25.93 
 
 
341 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  24.43 
 
 
361 aa  56.2  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  27.31 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  26.56 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.5 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  26.07 
 
 
290 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.65 
 
 
332 aa  53.5  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  25.7 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.51 
 
 
327 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  26.46 
 
 
340 aa  49.7  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.45 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0694  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.1 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.87 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  24.9 
 
 
328 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
328 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  28.16 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.13 
 
 
876 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
310 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  21.43 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.98 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.7 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.83 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>