More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5751 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5751  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
395 aa  732    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  63.74 
 
 
394 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5394  major facilitator transporter  50.64 
 
 
396 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326407  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0384  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 
411 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7927  major facilitator transporter  39.83 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437479  normal  0.239391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
392 aa  200  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  35.11 
 
 
390 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  35.11 
 
 
390 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  35.11 
 
 
390 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  35.11 
 
 
390 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  35.11 
 
 
390 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  35.11 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  34.83 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
400 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 
397 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  32.58 
 
 
391 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  37.36 
 
 
405 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  34.79 
 
 
406 aa  179  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.91 
 
 
391 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 
399 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  33.24 
 
 
391 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  33.33 
 
 
391 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  33.69 
 
 
403 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.71 
 
 
390 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
406 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  33.85 
 
 
389 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  33.85 
 
 
389 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  31.23 
 
 
392 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  34.63 
 
 
406 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  33.61 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  34.26 
 
 
389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.05 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  33.05 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  33.33 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  33.08 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  33.7 
 
 
408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04270  arabinose efflux permease family protein  36.29 
 
 
402 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  32.91 
 
 
407 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  32.56 
 
 
408 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 
407 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  30.77 
 
 
388 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
388 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  34.38 
 
 
383 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  36.34 
 
 
396 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  35.5 
 
 
408 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  32.41 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.1 
 
 
385 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
393 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
405 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  34.83 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  34.83 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  34.83 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  34.83 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  34.36 
 
 
389 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  33.24 
 
 
388 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  30.99 
 
 
430 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  34.27 
 
 
389 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  33 
 
 
388 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  34.27 
 
 
389 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  32.97 
 
 
378 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  34.27 
 
 
389 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  32.96 
 
 
388 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  33.43 
 
 
389 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  32.48 
 
 
411 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 
391 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24770  arabinose efflux permease family protein  34.49 
 
 
419 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  33.24 
 
 
412 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  35.31 
 
 
403 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  34.54 
 
 
391 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
404 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  34.41 
 
 
393 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  34.08 
 
 
391 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  33.05 
 
 
395 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  33.24 
 
 
384 aa  156  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  33.05 
 
 
395 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  30.73 
 
 
390 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.2 
 
 
391 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.2 
 
 
391 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  31.92 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  35 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  30.61 
 
 
399 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.2 
 
 
391 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.46 
 
 
391 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  32.69 
 
 
388 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.2 
 
 
391 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 
400 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  33.24 
 
 
391 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  34.58 
 
 
409 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  33.15 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  33.15 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  33.15 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  31.73 
 
 
395 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  32.69 
 
 
388 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
397 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
400 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  31.23 
 
 
423 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  35.67 
 
 
403 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 
386 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>