More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5301 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  659    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1460  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.87 
 
 
317 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.38 
 
 
317 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.92 
 
 
315 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.75 
 
 
337 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.9 
 
 
313 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  28.57 
 
 
313 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
311 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.68 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  27.49 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  23.98 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  29.32 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  23.58 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  28.69 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  28.11 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.18 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.61 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  21.32 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  22.76 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  24.38 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  27.13 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.37 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  23.84 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  23.97 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
350 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
746 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
353 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  31.11 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  24.84 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  26.09 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  26.09 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  23.6 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  29.79 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  25.76 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 
694 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79798  normal  0.123393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  26.71 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  26.71 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.1 
 
 
304 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  23.37 
 
 
332 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.68 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
346 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
329 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  24.79 
 
 
327 aa  59.3  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  32.58 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  25.47 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.62 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  32.26 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  31.07 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  32.02 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.550308  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.67 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  25.47 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  25.47 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  32.4 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
439 aa  56.6  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.67 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.67 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.67 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  21.36 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.38 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  26.01 
 
 
328 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  25.76 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  25.1 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  28.32 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>