46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4956 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  47.73 
 
 		 186 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  44.31 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  40.32 
 
 		 180 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  38.17 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  38.74 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  35.84 
 
 		 185 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  37.04 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  35.96 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  36.17 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  35.75 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  35.64 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  41.48 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  37.28 
 
 		 167 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  32.11 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  35.45 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  34.05 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  31.16 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  29.76 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  28.18 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  29.83 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  29.83 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  29.83 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  30.22 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  30.39 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  27.09 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.69 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  27.03 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0172  hypothetical protein  34.51 
 
 		 131 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  32.07 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  26.7 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  26.06 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  29.12 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4530  hypothetical protein  27.47 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  27.13 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  26.2 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  24.87 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  30.99 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  24.86 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  24.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  26.51 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  27.82 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  30.47 
 
 		 197 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>