More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3905 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
392 aa  741    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  58.42 
 
 
393 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  55.87 
 
 
390 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  55.87 
 
 
390 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  55.87 
 
 
390 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  55.59 
 
 
390 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  56.06 
 
 
392 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  55.87 
 
 
390 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  55.87 
 
 
390 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  55.59 
 
 
390 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  55.03 
 
 
388 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  54.47 
 
 
388 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  51.84 
 
 
391 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  51.85 
 
 
391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  51.85 
 
 
391 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  51.85 
 
 
416 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  54.85 
 
 
390 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  51.71 
 
 
391 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  51.59 
 
 
391 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  53.4 
 
 
397 aa  348  9e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  53.17 
 
 
391 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  50.91 
 
 
389 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  50.91 
 
 
389 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  52.6 
 
 
405 aa  346  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  50.65 
 
 
389 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  50.39 
 
 
389 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  50.39 
 
 
406 aa  338  8e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 
393 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  51.61 
 
 
388 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  49.87 
 
 
389 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  51.34 
 
 
388 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  50 
 
 
407 aa  332  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  52.71 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  52.71 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  52.71 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  52.47 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  52.71 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  51.69 
 
 
389 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  52.71 
 
 
389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  52.71 
 
 
389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  52.47 
 
 
389 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  51.3 
 
 
385 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  51.06 
 
 
408 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  44.62 
 
 
408 aa  319  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  49.01 
 
 
388 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 
406 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  48.73 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  49.74 
 
 
392 aa  312  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  45.71 
 
 
430 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  49.58 
 
 
406 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  46.32 
 
 
389 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 
400 aa  310  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  49.14 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  51.1 
 
 
407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  47.8 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  48.85 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  46.11 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  48.31 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  48.85 
 
 
391 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 
388 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  49.43 
 
 
386 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  49.11 
 
 
385 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  49.43 
 
 
386 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  49.43 
 
 
386 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  45.28 
 
 
412 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  48.73 
 
 
384 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 
388 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  49.86 
 
 
389 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.85 
 
 
388 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  46.48 
 
 
387 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  48.28 
 
 
400 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  43.16 
 
 
403 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  46.43 
 
 
395 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  44.67 
 
 
409 aa  292  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  47.91 
 
 
390 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  44.27 
 
 
414 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  46.15 
 
 
395 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  44.33 
 
 
391 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  42.63 
 
 
402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  42.86 
 
 
391 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 
400 aa  282  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  43.12 
 
 
391 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  42.86 
 
 
391 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  47.13 
 
 
393 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  43.67 
 
 
388 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  42.86 
 
 
391 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  42.86 
 
 
391 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 
405 aa  278  9e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  47.32 
 
 
388 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 
386 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  42.78 
 
 
396 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  47.32 
 
 
388 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  45.97 
 
 
404 aa  275  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  43.87 
 
 
403 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  43.18 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  42.08 
 
 
400 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  44.54 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  43.54 
 
 
391 aa  272  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 
399 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>