37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1699 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  100 
 
 
1127 aa  2256    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  35.05 
 
 
1104 aa  369  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 
1363 aa  313  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  31.15 
 
 
1076 aa  289  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  29.99 
 
 
1441 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  30.26 
 
 
1142 aa  283  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  27.23 
 
 
997 aa  278  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
1476 aa  276  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  33.28 
 
 
1096 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 
852 aa  235  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  30.58 
 
 
1171 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 
1114 aa  210  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  33.97 
 
 
1077 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  27.01 
 
 
1199 aa  95.5  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  25.04 
 
 
1051 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  28.48 
 
 
521 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
747 aa  82.8  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  22.6 
 
 
1007 aa  65.1  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  25.85 
 
 
565 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  38.89 
 
 
912 aa  59.3  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
916 aa  55.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  21.8 
 
 
1058 aa  54.7  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27 
 
 
827 aa  52.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
1162 aa  51.6  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 
1162 aa  51.6  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  21.92 
 
 
828 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
1276 aa  48.9  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 
1060 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
994 aa  48.1  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 
729 aa  47.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  35.09 
 
 
1147 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
2741 aa  47.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.02 
 
 
809 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
885 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.55 
 
 
991 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
1711 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
1779 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>