41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1233 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1139    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  36.8 
 
 		 507 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  38.66 
 
 		 501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  29.69 
 
 		 525 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  26.54 
 
 		 554 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  28.45 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  28.39 
 
 		 545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  30 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  28.86 
 
 		 609 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  27.3 
 
 		 594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  26.81 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  25.51 
 
 		 556 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  28.85 
 
 		 590 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  28.5 
 
 		 526 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  28.37 
 
 		 656 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  28.92 
 
 		 627 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  28.67 
 
 		 619 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  30.74 
 
 		 569 aa  117  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  29.38 
 
 		 615 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  29.48 
 
 		 615 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  29.48 
 
 		 615 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  28.1 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  26.08 
 
 		 368 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  32.3 
 
 		 507 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  28.53 
 
 		 561 aa  99.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  31.23 
 
 		 320 aa  94  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  29.68 
 
 		 557 aa  90.1  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  27.38 
 
 		 280 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  30.8 
 
 		 654 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  24.33 
 
 		 588 aa  79.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  32.01 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  28.91 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  28.85 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  31.17 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  30.53 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  25.48 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  27.54 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  27.93 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  29.73 
 
 		 234 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  27.62 
 
 		 547 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  24.16 
 
 		 564 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>