59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5062 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  44.3 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  38.7 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  40.31 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  38.21 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  39.07 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  32.64 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  37.96 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  35.27 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  33.61 
 
 		 247 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  33.61 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  33.2 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  42.04 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  33.19 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  33.2 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  33.2 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  33.2 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  32.78 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  30.86 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  32.16 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  30.67 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  31.3 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  29.41 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  33.8 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  32.58 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  32.31 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  30.4 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  31.58 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  32.64 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  32.48 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  37.3 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  36.08 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  30.45 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  31.16 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  31.54 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  34.84 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  27.65 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  29.49 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  33.53 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  22.65 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  22.88 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.73 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  28.26 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  22.46 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  22.46 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  27.12 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  22.88 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  22.88 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  29.7 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  28.09 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  23.08 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  23.08 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  27.92 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.67 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  22.03 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>