More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3588 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  100 
 
 		 362 aa  734    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  53.68 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  54.33 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.42 
 
 		 368 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.06 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.58 
 
 		 369 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.49 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.03 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  53.83 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.04 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  50.77 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  50.53 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  52.91 
 
 		 405 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  52.91 
 
 		 405 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  52.91 
 
 		 405 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.34 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  51.46 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.71 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  49.48 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.13 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  49.21 
 
 		 384 aa  363  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  52.21 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  51.72 
 
 		 367 aa  363  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  50.75 
 
 		 405 aa  362  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  49.87 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  52.6 
 
 		 349 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  49.21 
 
 		 370 aa  362  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  49.87 
 
 		 380 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 		 406 aa  361  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  49.47 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  51.51 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 370 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  54.22 
 
 		 354 aa  359  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.39 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  51.34 
 
 		 352 aa  358  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.34 
 
 		 370 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  52.14 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  52.42 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  53.11 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  55.72 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.87 
 
 		 367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  51.92 
 
 		 353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  49.08 
 
 		 371 aa  355  5.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.22 
 
 		 385 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  53.51 
 
 		 364 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  46.95 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.68 
 
 		 369 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.33 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  49.22 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  52.01 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 366 aa  352  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  50.27 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.53 
 
 		 349 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.05 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.71 
 
 		 379 aa  352  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.96 
 
 		 367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.96 
 
 		 367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 393 aa  352  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  51.23 
 
 		 368 aa  351  8.999999999999999e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.81 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  49.62 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.66 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  48.57 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.04 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.19 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.66 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  48.81 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  50.52 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  50.27 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 366 aa  349  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  50.97 
 
 		 351 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  49.86 
 
 		 360 aa  349  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  50.27 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  50.79 
 
 		 391 aa  349  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  51.51 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  50.13 
 
 		 393 aa  349  5e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 374 aa  348  8e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  48.28 
 
 		 371 aa  348  9e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  49.86 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  49.86 
 
 		 371 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.4 
 
 		 366 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.31 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  50.26 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  49.23 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  50.13 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  48.51 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  51.92 
 
 		 353 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  49.48 
 
 		 388 aa  347  3e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  50 
 
 		 365 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>