More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2111 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  60.49 
 
 
224 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  57.64 
 
 
224 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2916  O-methyltransferase  57.21 
 
 
206 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0820  methyltransferase type 11  51.8 
 
 
226 aa  211  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191685  normal  0.813143 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  52.86 
 
 
210 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  52.86 
 
 
210 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2022  methyltransferase type 11  52.11 
 
 
220 aa  204  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  50.72 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  51.43 
 
 
246 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  52.09 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3616  S-adenosylmethionine:diacylglycerol 3-amino-3-carboxypropyl transferase-like protein  51.66 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.324719  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  49.52 
 
 
234 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  49.07 
 
 
245 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  46.7 
 
 
224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.04 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.47 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.48 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  31.65 
 
 
771 aa  71.6  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.65 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42872  predicted protein  31.33 
 
 
808 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.53 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27669  predicted protein  26.26 
 
 
907 aa  65.5  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.84 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.19 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
349 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.39 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.24 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.84 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  36.13 
 
 
328 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30 
 
 
237 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
252 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.33 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.9 
 
 
265 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
327 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.77 
 
 
213 aa  61.6  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.11 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 
335 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.06 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.2 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
199 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.5 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.71 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  37.38 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.87 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
339 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 
252 aa  58.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  30.34 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  32 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.95 
 
 
269 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.41 
 
 
207 aa  58.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.64 
 
 
204 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  30.89 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.19 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
349 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
354 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0403  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.19 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306332  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  29.46 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  36.04 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  28.85 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.78 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.32 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
457 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.03 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  25.54 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.03 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.41 
 
 
345 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.06 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  30.33 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.01 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.58 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.21 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>