More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0253 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  76.61 
 
 		 464 aa  736    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0253  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 		 467 aa  935    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.456391  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  83.26 
 
 		 466 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  82 
 
 		 465 aa  750    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  55.7 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1657  flagellum-specific ATP synthase  57.48 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  57.59 
 
 		 442 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  57.59 
 
 		 442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  56.97 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  54.31 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  55.53 
 
 		 442 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0120  flagellum-specific ATP synthase  54.67 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1145  flagellum-specific ATP synthase  52.31 
 
 		 537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4214  flagellum-specific ATP synthase  55.64 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  54.57 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  53.53 
 
 		 439 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0129  flagellum-specific ATP synthase  50.8 
 
 		 422 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  50.28 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  48.99 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  49.16 
 
 		 441 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  48.72 
 
 		 445 aa  334  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  45.52 
 
 		 475 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  50.87 
 
 		 441 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  48.88 
 
 		 441 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  48.88 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  45.54 
 
 		 450 aa  329  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  44.29 
 
 		 452 aa  326  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  52.32 
 
 		 440 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  47.15 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  51.52 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  45.54 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  49.17 
 
 		 455 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  47.87 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  45.54 
 
 		 451 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  51.23 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  50.94 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  44.23 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  42.11 
 
 		 431 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  49.29 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  44.39 
 
 		 437 aa  299  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  41.65 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  50.29 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  47.12 
 
 		 489 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  47.95 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  45.69 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  43.26 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  43.78 
 
 		 435 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  46.55 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  47.06 
 
 		 488 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  41.16 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  42.07 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  43.38 
 
 		 480 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  43.8 
 
 		 464 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  42.47 
 
 		 433 aa  290  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  47.16 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.66 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  43.93 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2966  ATP synthase FliI/YscN  39.66 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  42.43 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  43.03 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  44.1 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  43.22 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  40.88 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  45.63 
 
 		 478 aa  286  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  46.22 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2085  flagellum-specific ATP synthase  39.67 
 
 		 436 aa  285  8e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  43.37 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  46.55 
 
 		 466 aa  285  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  42.22 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0188  flagellum-specific ATP synthase  38.59 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  40.99 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  41.03 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0226  flagellum-specific ATP synthase  38.59 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  46.93 
 
 		 487 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  49.13 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  43.41 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  40.56 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  42.46 
 
 		 445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  40.74 
 
 		 446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.43 
 
 		 509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  42.46 
 
 		 445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  43.32 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  42.46 
 
 		 445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0205  flagellum-specific ATP synthase  38.57 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  47.13 
 
 		 526 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  45.59 
 
 		 446 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  47.13 
 
 		 513 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.13 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3278  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.13 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3403  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.13 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  49.85 
 
 		 435 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0231  flagellar protein export ATPase FliI  47.13 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  47.13 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2943  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.13 
 
 		 523 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  42.56 
 
 		 437 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  40.55 
 
 		 442 aa  282  8.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1482  flagellum-specific ATP synthase  40.33 
 
 		 436 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  41.52 
 
 		 445 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  42.21 
 
 		 445 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  46.95 
 
 		 449 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>