36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2940 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  567  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  27.97 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  30.79 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  28.34 
 
 
318 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  27.44 
 
 
315 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  28.98 
 
 
318 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  27.13 
 
 
315 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  25.87 
 
 
322 aa  99.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  28.16 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  26.98 
 
 
321 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  29.87 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  24.92 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  25.9 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  25.63 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  26.42 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  25.32 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  27.72 
 
 
258 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  32.79 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  24.52 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  23.86 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  31.03 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  28.22 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  28.91 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  31.16 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  30.67 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  29.82 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  30.91 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  34.38 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  31.56 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  27.17 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  24.41 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2888  hypothetical protein  40.48 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  25.8 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  26.83 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1356  hypothetical protein  36.21 
 
 
309 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0213142  decreased coverage  0.000111043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>