More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3664 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  66.63 
 
 		 838 aa  1130    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  63.15 
 
 		 898 aa  1095    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  61.48 
 
 		 880 aa  1014    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  66.91 
 
 		 838 aa  1127    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  56.97 
 
 		 845 aa  897    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  59.08 
 
 		 880 aa  970    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  58.79 
 
 		 776 aa  917    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  65.75 
 
 		 897 aa  1169    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  66.48 
 
 		 950 aa  1166    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  64.19 
 
 		 877 aa  1125    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  71.22 
 
 		 843 aa  1222    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  63.15 
 
 		 898 aa  1094    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  69.62 
 
 		 844 aa  1166    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  62.49 
 
 		 899 aa  1076    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  58.5 
 
 		 834 aa  991    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  100 
 
 		 832 aa  1697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  63.96 
 
 		 894 aa  1087    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05010  Excinuclease ATPase subunit  48.48 
 
 		 875 aa  701    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  65.72 
 
 		 899 aa  1170    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  66.55 
 
 		 838 aa  1109    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  69 
 
 		 861 aa  1180    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  66.3 
 
 		 853 aa  1114    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  57.64 
 
 		 863 aa  952    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  56.62 
 
 		 827 aa  912    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  69.69 
 
 		 850 aa  1185    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  61.33 
 
 		 848 aa  1009    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  61.21 
 
 		 848 aa  1009    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  65.37 
 
 		 822 aa  1081    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  61.64 
 
 		 833 aa  975    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  66.91 
 
 		 838 aa  1105    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  60.48 
 
 		 843 aa  984    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  59.48 
 
 		 860 aa  984    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  62.87 
 
 		 881 aa  1075    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  65.32 
 
 		 885 aa  1118    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  61.21 
 
 		 848 aa  1009    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  60.24 
 
 		 851 aa  942    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  64.51 
 
 		 944 aa  1058    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  46.01 
 
 		 968 aa  607  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  46.66 
 
 		 945 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  46.58 
 
 		 946 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  45.31 
 
 		 961 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  46.85 
 
 		 957 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2988  excinuclease ABC subunit A  46.52 
 
 		 973 aa  595  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3032  excinuclease ABC subunit A  46.52 
 
 		 973 aa  595  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.69865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3003  excinuclease ABC subunit A  46.38 
 
 		 973 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.855569  normal  0.034696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  46.09 
 
 		 946 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1542  excinuclease ABC, A subunit  44.43 
 
 		 965 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.464882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  44.68 
 
 		 942 aa  592  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11654  excinuclease ABC subunit A  46.68 
 
 		 972 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6045  excinuclease ABC subunit A  44.84 
 
 		 946 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.834052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  41.82 
 
 		 939 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  44.24 
 
 		 954 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  45.52 
 
 		 947 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2422  excinuclease ABC, A subunit  45.54 
 
 		 952 aa  583  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  41.62 
 
 		 939 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2940  excinuclease ABC subunit A  45.36 
 
 		 995 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  45.5 
 
 		 976 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  44.21 
 
 		 1019 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3339  excinuclease ABC subunit A  45.9 
 
 		 967 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3548  excinuclease ABC subunit A  46.04 
 
 		 967 aa  582  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658203  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2079  excinuclease ABC subunit A  45.03 
 
 		 975 aa  582  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.224045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  43.89 
 
 		 983 aa  579  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1422  excinuclease ABC, A subunit  44.4 
 
 		 963 aa  578  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0151035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1820  excinuclease ABC subunit A  44.82 
 
 		 973 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  46.15 
 
 		 975 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  43.68 
 
 		 952 aa  577  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2178  excinuclease ABC subunit A  44.99 
 
 		 965 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  43.76 
 
 		 921 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  43.74 
 
 		 962 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3018  excinuclease ABC, A subunit  45.89 
 
 		 948 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.244171  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25750  excinuclease ABC subunit A  45.12 
 
 		 953 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  44.81 
 
 		 960 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2057  excinuclease ABC subunit A  44.95 
 
 		 965 aa  572  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  44.73 
 
 		 987 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  43.88 
 
 		 964 aa  570  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  45.47 
 
 		 971 aa  572  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  44.19 
 
 		 955 aa  572  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  44.52 
 
 		 963 aa  572  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1406  excinuclease ABC, A subunit  42.92 
 
 		 935 aa  571  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  43.86 
 
 		 941 aa  572  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  43.78 
 
 		 944 aa  570  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  43.48 
 
 		 960 aa  572  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  44.87 
 
 		 987 aa  572  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  44.23 
 
 		 937 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  42.41 
 
 		 942 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  41.95 
 
 		 958 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  41.95 
 
 		 958 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  41.81 
 
 		 958 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  41.95 
 
 		 958 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  44.11 
 
 		 956 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  42.37 
 
 		 927 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  44.95 
 
 		 982 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  45.25 
 
 		 971 aa  568  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  41.95 
 
 		 958 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  43.76 
 
 		 957 aa  568  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0260  excinuclease ABC, A subunit  43.47 
 
 		 947 aa  567  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0669187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  41.95 
 
 		 958 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5483  excinuclease ABC subunit A  44.73 
 
 		 954 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  41.81 
 
 		 958 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  41.81 
 
 		 958 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>