More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3237 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3237  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 365 aa  746    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4612  transcriptional regulator, GntR family  48.66 
 
 		 339 aa  305  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4808  transcriptional regulator, GntR family  47.18 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4217  regulatory protein GntR, HTH  42.69 
 
 		 346 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.53296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0954  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3881  regulatory protein GntR HTH  41.46 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1116  regulatory protein GntR, HTH  36.7 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3120  regulatory protein GntR HTH  35.47 
 
 		 337 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1999  regulatory protein GntR, HTH  33.14 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5298  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.278192  normal  0.0567929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3597  regulatory protein GntR HTH  33.23 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.848461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5644  regulatory protein GntR HTH  28.91 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961176  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  40.24 
 
 		 139 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  43.48 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  40.26 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.79 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 138 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  29.32 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.97 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 100 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  21.51 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1264  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0162673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  41.46 
 
 		 241 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  36.49 
 
 		 126 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  36.49 
 
 		 126 aa  57  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  29.09 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 125 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5105  histidine utilization repressor  39.53 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0431147  hitchhiker  0.00830494 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.58 
 
 		 493 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  42.86 
 
 		 124 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  37.18 
 
 		 122 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.55 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.67 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 123 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 123 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 127 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 134 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 119 aa  54.3  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.17 
 
 		 253 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  32.28 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 92 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 484 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 240 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  37.88 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  35.16 
 
 		 239 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 478 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  39.71 
 
 		 240 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  39.71 
 
 		 240 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  39.71 
 
 		 240 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  39.71 
 
 		 240 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  39.71 
 
 		 240 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 234 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.78 
 
 		 247 aa  53.1  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 244 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.91 
 
 		 240 aa  53.1  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  37.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  37.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 463 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 124 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  37.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  37.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  37.88 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 477 aa  53.1  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  39.39 
 
 		 235 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  39.39 
 
 		 235 aa  52.8  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 244 aa  53.1  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 125 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 234 aa  52.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.59 
 
 		 491 aa  52.8  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>