196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3075 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3075  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 		 328 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.698779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2494  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120593  normal  0.158717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01560  alpha/beta hydrolase superfamily protein  38.38 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0244  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3278  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  31.97 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  24.88 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.36 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 290 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  34 
 
 		 453 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 504 aa  52.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  31.73 
 
 		 462 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  37.7 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  29.07 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  34.26 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 462 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.13 
 
 		 372 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05110  expressed protein  28.8 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.81 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  28.32 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  28.32 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  32.04 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.54 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  32.04 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  28.32 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  34.91 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  32.04 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11771  Alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  32.04 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  32.04 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.43 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.81 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.43 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 277 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 272 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.97 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 240 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>