More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2901 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 154 aa  316  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  58.62 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 152 aa  184  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  41.06 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.33 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  42 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 181 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  40.4 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  44.3 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  44.3 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 172 aa  127  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 152 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 180 aa  124  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 164 aa  123  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  43.33 
 
 		 229 aa  123  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 175 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  43.87 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  43.14 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  41.33 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  42 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.67 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.67 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.67 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.67 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  41.83 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  42.67 
 
 		 229 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  41.06 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  41.06 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.13 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.33 
 
 		 169 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  41.72 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  36.67 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1442  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>