More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2616 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.54 
 
 		 1460 aa  1293    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  55.14 
 
 		 1072 aa  1156    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1087 aa  2197    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  52.79 
 
 		 1104 aa  1148    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  60.17 
 
 		 1075 aa  1303    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  53.92 
 
 		 1086 aa  1175    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  53.51 
 
 		 1095 aa  1157    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  58.55 
 
 		 1052 aa  1241    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 		 1072 aa  625  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  34.34 
 
 		 1061 aa  621  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  34.8 
 
 		 1064 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  35.6 
 
 		 1072 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  34.65 
 
 		 1064 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 		 1072 aa  609  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  34.66 
 
 		 1063 aa  609  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  33.77 
 
 		 1084 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  33.77 
 
 		 1084 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  33.77 
 
 		 1084 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  32.99 
 
 		 1060 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1055 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  32.99 
 
 		 1060 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  35.06 
 
 		 1082 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  34.18 
 
 		 1078 aa  595  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  34.73 
 
 		 1064 aa  595  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  33.9 
 
 		 1055 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  34.78 
 
 		 1082 aa  592  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 		 1082 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  34.18 
 
 		 1055 aa  588  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 		 1061 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  33.9 
 
 		 1055 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1055 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  33.9 
 
 		 1055 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.27 
 
 		 1056 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 		 1057 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  33.58 
 
 		 1068 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  33.58 
 
 		 1068 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1055 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  33.74 
 
 		 1064 aa  580  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  33.83 
 
 		 1076 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  33.8 
 
 		 1076 aa  582  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  34.05 
 
 		 1064 aa  579  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1084 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1052 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1065 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  34.27 
 
 		 1082 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  34.27 
 
 		 1082 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  32.62 
 
 		 1081 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1058 aa  568  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  32.96 
 
 		 1057 aa  568  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1065 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  32.83 
 
 		 1072 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  32.93 
 
 		 1073 aa  559  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1044 aa  559  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1065 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.16 
 
 		 1462 aa  545  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1057 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0122  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1122 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  32.38 
 
 		 1080 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.29 
 
 		 1049 aa  527  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1076 aa  529  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1076 aa  529  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1070 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1109 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1090 aa  492  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1087 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1050 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1034 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.81 
 
 		 1496 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1041 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1043 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1011 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.99 
 
 		 1065 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1032 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1046 aa  376  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.29 
 
 		 1069 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1095 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1044 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1070 aa  366  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1055 aa  363  9e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1043 aa  361  5e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 1036 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1039 aa  356  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1058 aa  353  8e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1470 aa  353  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1040 aa  352  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1048 aa  349  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1066 aa  349  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1075 aa  349  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1029 aa  347  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1059 aa  347  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1028 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1028 aa  346  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1038 aa  344  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1034 aa  343  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1071 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1041 aa  338  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  25.3 
 
 		 1058 aa  337  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.28 
 
 		 1049 aa  335  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1039 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27.97 
 
 		 1033 aa  335  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>