More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_20550  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
733 aa  1403    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375054  normal  0.44591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
710 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142887  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.76 
 
 
715 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
702 aa  365  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.79 
 
 
718 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.2 
 
 
699 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1336  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  31.28 
 
 
740 aa  263  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000730785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  29.8 
 
 
998 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3046  putative PAS/PAC sensor protein  34.56 
 
 
660 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.02 
 
 
686 aa  217  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2467  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  27.38 
 
 
729 aa  207  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 
536 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.85 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  36.27 
 
 
542 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  39.17 
 
 
347 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
977 aa  180  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 
542 aa  180  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  29.46 
 
 
808 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  39.39 
 
 
540 aa  178  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 
394 aa  177  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
518 aa  177  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  37.22 
 
 
545 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  40.13 
 
 
543 aa  174  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
528 aa  174  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 
537 aa  172  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
544 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.85 
 
 
667 aa  171  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 
667 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135223  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 
545 aa  171  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 
667 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.92 
 
 
522 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 
531 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.93 
 
 
667 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
538 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  26.86 
 
 
658 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.37 
 
 
667 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.37 
 
 
667 aa  168  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000241408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  28.52 
 
 
658 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 
561 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
535 aa  167  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.82 
 
 
532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 
538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.1 
 
 
658 aa  164  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 
667 aa  164  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 
683 aa  164  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  37.95 
 
 
540 aa  163  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.07 
 
 
659 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.24 
 
 
567 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.28 
 
 
668 aa  162  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 
523 aa  161  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.47 
 
 
667 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.82 
 
 
667 aa  158  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  38.08 
 
 
533 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
538 aa  157  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.63 
 
 
681 aa  157  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.766428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  40.35 
 
 
538 aa  156  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 
535 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 
643 aa  156  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.81 
 
 
646 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00540264  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.65 
 
 
667 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.49 
 
 
1150 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.36 
 
 
546 aa  155  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.48 
 
 
667 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.17 
 
 
660 aa  154  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520721  normal  0.510764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  36.42 
 
 
562 aa  154  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  25.68 
 
 
678 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 
660 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 
660 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.8 
 
 
539 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 
667 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 
526 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  24.27 
 
 
656 aa  152  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 
531 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 
904 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.17 
 
 
660 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.46 
 
 
651 aa  151  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  37.17 
 
 
540 aa  150  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 
529 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 
547 aa  150  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 
623 aa  150  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  27.11 
 
 
667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.56 
 
 
719 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.38 
 
 
646 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.77 
 
 
646 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.5 
 
 
656 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 
544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 
530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 
660 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.85 
 
 
666 aa  146  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  31.03 
 
 
661 aa  145  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 
524 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 
535 aa  145  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  38.69 
 
 
533 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  30.8 
 
 
565 aa  143  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 
672 aa  143  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  33.43 
 
 
407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.38 
 
 
657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.068141  normal  0.373533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32 
 
 
651 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>