145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12480  cation/cationic drug transporter  100 
 
 		 127 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  54.05 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  48.18 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  48.18 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  48.18 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  50.47 
 
 		 113 aa  87.4  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  55.34 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  49.49 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  42.59 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  40.74 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  39.64 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  39.64 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  38.54 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1670  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774613  hitchhiker  0.00381818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  41 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  44.19 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  44.19 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  44.19 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  34.91 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  28.1 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  31 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  34.55 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  34.02 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  32.38 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.67 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  31 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.67 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  32.69 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  32.98 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  29.31 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  31.48 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  31.48 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  31.48 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  32.5 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  31.48 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  31.48 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  31.19 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  28.57 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5725  SMR multidrug efflux transporter  34.04 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  28.57 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  28.57 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  28.57 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  28.57 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  28.57 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  28.57 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5493  small multidrug resistance protein  34.72 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  0.39797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>