More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  55.51 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  51.64 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  51.94 
 
 		 204 aa  187  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  47.09 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  49.01 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  43.96 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  43.41 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  41.78 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  44.78 
 
 		 228 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  34.22 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  44.33 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  42 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  42.08 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  35.9 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  39.51 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  40.76 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 225 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  38.51 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 208 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.21 
 
 		 442 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.64 
 
 		 442 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.36 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  41.96 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  42.19 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  41.26 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.64 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  41.96 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  44.34 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  36.56 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  41.26 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 459 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  42.19 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  42.19 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  42.19 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.98 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.95 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>