298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3667 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3667  MgtE integral membrane region  100 
 
 		 456 aa  918    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000256  putative magnesium transporter MgtE  46.35 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  38.5 
 
 		 443 aa  263  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  36.64 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  35.63 
 
 		 455 aa  237  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  36.63 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  35.37 
 
 		 458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  36.47 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  35.29 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  35.05 
 
 		 456 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  36.12 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  34.3 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  35.73 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  35.01 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  34.8 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  34.29 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  34.8 
 
 		 456 aa  225  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  34.46 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  35.06 
 
 		 456 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  32.78 
 
 		 454 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  31.91 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  35.56 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  35.56 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  35.56 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  34.2 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  35.56 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  35.18 
 
 		 450 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  35.92 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  32.68 
 
 		 481 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  32.54 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  32.46 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  32.54 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  32.54 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  32.85 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  32.23 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  33.09 
 
 		 480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  32.85 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  33.09 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  32.85 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  32.82 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  34.43 
 
 		 467 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  35.28 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  33.33 
 
 		 455 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  31.99 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  34.19 
 
 		 467 aa  212  9e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  31.68 
 
 		 454 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  33.09 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  33.41 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  32.86 
 
 		 480 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  33.99 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  33.33 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  33.1 
 
 		 480 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  32.94 
 
 		 480 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  32.62 
 
 		 480 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  32.62 
 
 		 480 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  32.86 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0180  divalent cation transporter, putative magnesium transporter  33.97 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.881187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  33.02 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  34.96 
 
 		 454 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  35.31 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  34.63 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  33.89 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  31.22 
 
 		 479 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  33.25 
 
 		 463 aa  203  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2758  MgtE integral membrane region  34.13 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  32.04 
 
 		 453 aa  199  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  32.29 
 
 		 473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  30.6 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  30.18 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  32.62 
 
 		 451 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  35.73 
 
 		 482 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  35.73 
 
 		 482 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  33.64 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  34.13 
 
 		 462 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  30.32 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  30.52 
 
 		 470 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  36.59 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  30.41 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  32.14 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  30.66 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  30.66 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  30.66 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  32.41 
 
 		 477 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  29.62 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  32.2 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  30.82 
 
 		 481 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  30.86 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  30.36 
 
 		 481 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  31.59 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  33.41 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  33.18 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  30 
 
 		 471 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  30 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  30.33 
 
 		 461 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  30.14 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  31.9 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  30.16 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  31.53 
 
 		 494 aa  176  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  29.66 
 
 		 482 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>