More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0999 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  891    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  98.17 
 
 		 436 aa  878    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  98.39 
 
 		 436 aa  881    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  98.62 
 
 		 436 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  75.92 
 
 		 436 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  95.64 
 
 		 436 aa  816    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  69.11 
 
 		 437 aa  614  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  71.1 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  66.28 
 
 		 433 aa  609  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  64.45 
 
 		 433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  65.6 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  62.84 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  63.62 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  63.16 
 
 		 434 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  63.16 
 
 		 434 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  39.14 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  36.57 
 
 		 435 aa  279  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  39.09 
 
 		 432 aa  269  8e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  27.19 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  24.43 
 
 		 802 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.75 
 
 		 844 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.23 
 
 		 805 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 		 785 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  24.55 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  23.48 
 
 		 810 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.54 
 
 		 805 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  21.85 
 
 		 808 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  22.13 
 
 		 797 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 805 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 		 793 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  22.37 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.31 
 
 		 808 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.04 
 
 		 795 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  25.49 
 
 		 801 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.16 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  23.03 
 
 		 805 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  21.52 
 
 		 805 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  24.8 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 		 789 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  23.95 
 
 		 647 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  21.21 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  24.78 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 		 770 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 		 808 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  23.04 
 
 		 798 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  22.5 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  24.58 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  25.24 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  24.3 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0683  ABC transporter, permease protein, putative  24.84 
 
 		 788 aa  76.6  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0106782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 		 807 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  23.57 
 
 		 800 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  26.14 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 		 791 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 		 795 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.2 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  22.1 
 
 		 798 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  22.33 
 
 		 657 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 801 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  22.62 
 
 		 800 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 809 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 		 791 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  23.26 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  22.75 
 
 		 780 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  21.41 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.35 
 
 		 882 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  22.56 
 
 		 654 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  20.22 
 
 		 804 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  25.6 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.6 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  24.34 
 
 		 804 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24 
 
 		 798 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.05 
 
 		 656 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.15 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  21.64 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.61 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  23.1 
 
 		 667 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 798 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 		 811 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 804 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  20.73 
 
 		 806 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 		 797 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  23.42 
 
 		 656 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  25.34 
 
 		 653 aa  70.1  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.08 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.08 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  23.1 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.19 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 789 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  21.25 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  25.74 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  25.93 
 
 		 807 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>