More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  82.22 
 
 
183 aa  313  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  78.53 
 
 
180 aa  300  6.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  67.04 
 
 
186 aa  264  5e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  61.88 
 
 
182 aa  250  8.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  64.77 
 
 
180 aa  248  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 
179 aa  246  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
194 aa  245  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  245  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
198 aa  244  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
180 aa  243  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 
180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
193 aa  241  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
180 aa  241  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
181 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  62.29 
 
 
180 aa  239  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  63.48 
 
 
191 aa  239  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 
182 aa  240  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
193 aa  239  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  59.32 
 
 
179 aa  239  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  61.8 
 
 
191 aa  239  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  62.78 
 
 
191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  60.11 
 
 
189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 
182 aa  238  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  238  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  238  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  238  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
180 aa  237  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
192 aa  237  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
178 aa  237  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
180 aa  237  6.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  237  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  236  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  235  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  235  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  62.36 
 
 
192 aa  236  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  57.78 
 
 
220 aa  235  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  235  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  235  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  59.55 
 
 
183 aa  235  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  235  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  235  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  235  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  235  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  235  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  235  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  61.67 
 
 
190 aa  234  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  234  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  234  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  234  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  60.56 
 
 
190 aa  234  6e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  234  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
191 aa  234  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 
189 aa  234  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  58.76 
 
 
180 aa  233  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  62.64 
 
 
178 aa  233  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  233  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 
190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  61.24 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
180 aa  232  3e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  231  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
183 aa  231  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  231  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  231  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
180 aa  231  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
188 aa  231  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  61.02 
 
 
191 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>