More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12950  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 345 aa  716    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.765699  normal  0.148306 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08670  branched-chain amino acid aminotransferase  85.76 
 
 		 345 aa  625  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00341409  normal  0.322346 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1071  branched-chain amino acid aminotransferase  68.79 
 
 		 348 aa  509  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1296  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 		 344 aa  345  8.999999999999999e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.181598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1772  branched-chain amino acid aminotransferase  49.28 
 
 		 341 aa  335  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0397129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1501  branched-chain amino acid aminotransferase  49.28 
 
 		 341 aa  335  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0635  branched-chain amino acid aminotransferase  49.85 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000185267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1152  branched-chain amino acid aminotransferase  48.97 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000440296  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0494  branched-chain amino acid aminotransferase  48.68 
 
 		 339 aa  325  8.000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0962388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1148  branched-chain amino acid aminotransferase  47.38 
 
 		 339 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1332  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3511  branched-chain amino acid aminotransferase  47.83 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2264  branched-chain amino acid aminotransferase  47.54 
 
 		 339 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2417  branched-chain amino acid aminotransferase  47.25 
 
 		 339 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2743  branched-chain amino acid aminotransferase  47.37 
 
 		 339 aa  315  7e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2410  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 339 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1409  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3467  branched-chain amino acid aminotransferase  46.38 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1319  branched-chain amino acid aminotransferase  46.63 
 
 		 347 aa  282  8.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.724112  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1290  branched-chain amino acid aminotransferase  45.29 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  42.69 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  43.99 
 
 		 367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  43.4 
 
 		 359 aa  265  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  42.52 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  41.48 
 
 		 379 aa  252  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  40.94 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  40.94 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  40.94 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  39.61 
 
 		 370 aa  245  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  39.42 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  41.72 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  40.29 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  40.64 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50793  predicted protein  41.48 
 
 		 409 aa  242  6e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.141082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 377 aa  242  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  40.18 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  40.74 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  38.68 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  39.61 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  40.41 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  41.59 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  39.13 
 
 		 367 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  41.35 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  40.06 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  40.59 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  41.3 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  41.3 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  40.12 
 
 		 364 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  39.53 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  40.47 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  40.7 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  40.7 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  40.7 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  41.37 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  39.65 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  42.23 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 366 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  40.36 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  39.77 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  40.41 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  40.94 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  40.18 
 
 		 370 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  39.82 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  41.54 
 
 		 359 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  38.01 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  39.3 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1130  branched-chain amino acid aminotransferase  40.29 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  39.94 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  38.9 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  39.24 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  38.53 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  38.53 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31397  predicted protein  39.76 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.635842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  38.05 
 
 		 375 aa  220  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18760  branched chain amino acid aminotransferase  39.41 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  36.92 
 
 		 358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  37.65 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  35.94 
 
 		 366 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  38.53 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  36.66 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1168  branched-chain amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 368 aa  218  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.882569  normal  0.0790533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  38.95 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  38.17 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  38.17 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  38.42 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  38.3 
 
 		 361 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  37.9 
 
 		 371 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>