More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0974 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  690    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  62.06 
 
 
341 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  62.35 
 
 
341 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  59.64 
 
 
337 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  60.18 
 
 
328 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  54.93 
 
 
345 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  54.28 
 
 
345 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  54.28 
 
 
345 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  54.33 
 
 
342 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  52.4 
 
 
352 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  53.43 
 
 
341 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  48.06 
 
 
350 aa  353  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  47.9 
 
 
339 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  40.73 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  41.67 
 
 
358 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  42.28 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4060  oxidoreductase domain-containing protein  40.65 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  40.83 
 
 
387 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2701  oxidoreductase domain protein  42.9 
 
 
347 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  38.35 
 
 
364 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  39.3 
 
 
371 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  32.53 
 
 
344 aa  195  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  33.23 
 
 
334 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 
345 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
351 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 
315 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
317 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
517 aa  162  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  31.93 
 
 
517 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 
343 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 
343 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  33.33 
 
 
335 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
326 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
353 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  30.96 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  25.77 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 
361 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  31.12 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.34 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  31.63 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2215  oxidoreductase-like  27.14 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.25 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.25 
 
 
318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 
311 aa  124  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.42 
 
 
312 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  30.28 
 
 
310 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  29.2 
 
 
345 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.46 
 
 
346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 
344 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
327 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  29.2 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  32.17 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.3 
 
 
313 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1326  hypothetical protein  28.27 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1323  hypothetical protein  28.44 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
315 aa  112  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  27.36 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.14 
 
 
319 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1494  oxidoreductase domain-containing protein  24.01 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.76 
 
 
310 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
331 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  28.34 
 
 
321 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 
337 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  27.43 
 
 
334 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  29.88 
 
 
332 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  27.25 
 
 
332 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 
320 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
326 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  27.93 
 
 
319 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 
338 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  27.71 
 
 
355 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  27.73 
 
 
332 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  27.74 
 
 
649 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  26.55 
 
 
334 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
327 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  27.76 
 
 
327 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
318 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  26.84 
 
 
334 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
344 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.83 
 
 
310 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  25.96 
 
 
328 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 
353 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  27.87 
 
 
346 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1993  oxidoreductase domain-containing protein  31.8 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.77 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25.66 
 
 
334 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  27.85 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.8 
 
 
345 aa  96.3  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  24.85 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  25 
 
 
337 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>