More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3467 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  56.84 
 
 		 295 aa  308  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  45.07 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  46.85 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  46.85 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 		 298 aa  221  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  32.86 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  32.87 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  35.71 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.59 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  32.52 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  32.59 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.51 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.16 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  31.01 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  31.8 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  31.8 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  31.8 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  32.68 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.41 
 
 		 314 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  31.12 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  31.86 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  32.86 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  29.82 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.74 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.74 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.91 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  29.59 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  31.1 
 
 		 331 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 325 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  32.06 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  32.06 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 329 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  32.06 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  31.96 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  32.06 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  31.71 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  31.07 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  31.69 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  31.1 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  30.66 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  30.42 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  30.4 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  30.4 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.07 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  36.4 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  28.86 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  29.33 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  35.36 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  29.23 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 		 325 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  29 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  29.74 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  27.07 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  31.41 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0922  cation efflux protein  30.77 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.134705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  31.74 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  31.85 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0153  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0646969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>