95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2656 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  100 
 
 		 418 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  88.28 
 
 		 418 aa  712    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  99.52 
 
 		 418 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  99.52 
 
 		 418 aa  839    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  77.99 
 
 		 418 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  99.28 
 
 		 418 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  98.8 
 
 		 418 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  88.28 
 
 		 418 aa  711    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  65.07 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  66.5 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  65.07 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  59.09 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  59.09 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  59.09 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  58.85 
 
 		 418 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  58.85 
 
 		 418 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  57.18 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  57.66 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  57.66 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  57.66 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  57.66 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  57.66 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  57.66 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  57.66 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  57.66 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  57.42 
 
 		 418 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  54.84 
 
 		 411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  51.9 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  52.84 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  48.37 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  35.99 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  36.41 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  35.88 
 
 		 410 aa  239  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  34.8 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  36.27 
 
 		 405 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  33.07 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  33.66 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  32.91 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  32.53 
 
 		 415 aa  203  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  32.11 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  29.55 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  29.55 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  29.55 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  29.55 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  29.55 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  29.55 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  29.55 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  28.27 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  29.31 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  31.8 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  28.88 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  28.88 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  28.88 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  28.88 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  28.88 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  30.6 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  32.45 
 
 		 419 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  29.85 
 
 		 425 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  31.07 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  30.14 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  27.51 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  28.98 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  24.46 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  21.87 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  20.23 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  28.77 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  23.96 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  20.18 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  21.2 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  21.16 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  20.35 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  20.96 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  21.35 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>