More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3417 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3417  putative cobalt ABC transporter ATPase  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0943741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3312  putative ABC-type cobalt transport system, ATPase component  99.08 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3237  putative ABC-type cobalt transport system, ATPase component  98.17 
 
 		 218 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.953172  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3248  putative ABC-type cobalt transport system, ATPase component  95.81 
 
 		 229 aa  420  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3315  putative ABC-type cobalt transport system ATPase  97.21 
 
 		 229 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4230  ABC transporter, ATP-binding protein  75.47 
 
 		 225 aa  338  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3070  ABC transporter, ATP-binding protein  74.53 
 
 		 225 aa  336  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296088 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3358  ABC transporter, ATP-binding protein  74.06 
 
 		 236 aa  337  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.742624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3263  ABC transporter, ATP-binding protein  73.58 
 
 		 236 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.756831  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  37.96 
 
 		 501 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 568 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  35.81 
 
 		 582 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  36.74 
 
 		 568 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.14 
 
 		 810 aa  132  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  33.65 
 
 		 605 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  33.18 
 
 		 593 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.13 
 
 		 281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1951  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.24 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  34.1 
 
 		 541 aa  128  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  31.51 
 
 		 282 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.19 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.99 
 
 		 281 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.77 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.41 
 
 		 278 aa  125  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  40.29 
 
 		 325 aa  125  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  30 
 
 		 281 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3474  ABC transporter related  32.39 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  31.5 
 
 		 280 aa  124  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 491 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4750  ABC transporter  36.65 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199681  normal  0.0424479 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  32.54 
 
 		 569 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  32.08 
 
 		 581 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  36.62 
 
 		 574 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5336  cell division ATP-binding protein FtsE  37.1 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1646  ABC transporter related  38.05 
 
 		 556 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5160  cell division ATP-binding protein FtsE  36.65 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5110  cell division ATP-binding protein FtsE  36.65 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  34.17 
 
 		 497 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0355  cell division ATP-binding protein FtsE  36.65 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4983  cell division ATP-binding protein FtsE  36.65 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48090  Cell-division ATP-binding protein FtsE  37.56 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  31.22 
 
 		 286 aa  121  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  29.91 
 
 		 501 aa  121  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0428  cell division ATP-binding protein FtsE  35.75 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.25 
 
 		 274 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.24 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4174  cell division ATP-binding protein FtsE  37.1 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00105133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 		 509 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  33.49 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1255  ABC transporter related  33.33 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  29.91 
 
 		 283 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  30.77 
 
 		 275 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0336  ABC transporter related  30.84 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0600592 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.46 
 
 		 548 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.68 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  34.55 
 
 		 339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  32.87 
 
 		 398 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  32.67 
 
 		 568 aa  118  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.11 
 
 		 277 aa  118  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.73 
 
 		 271 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  32.85 
 
 		 571 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  35.53 
 
 		 571 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  34.82 
 
 		 524 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.34 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.59 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.24 
 
 		 286 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.39 
 
 		 363 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  27.98 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  34.55 
 
 		 363 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  30.49 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  34.39 
 
 		 363 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.96 
 
 		 564 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  27.27 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.5 
 
 		 305 aa  115  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  32.09 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.95 
 
 		 282 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.47 
 
 		 280 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 		 566 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  31.79 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  36.1 
 
 		 292 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  32.39 
 
 		 553 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.12 
 
 		 574 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  31.05 
 
 		 490 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  35.03 
 
 		 360 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  32.88 
 
 		 641 aa  114  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.44 
 
 		 254 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 		 770 aa  114  8.999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.77 
 
 		 280 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 491 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.95 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.41 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.95 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.03 
 
 		 395 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.32 
 
 		 481 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.77 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.48 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  35.05 
 
 		 368 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>