More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3358 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3358  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.742624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3263  ABC transporter, ATP-binding protein  98.31 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.756831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4230  ABC transporter, ATP-binding protein  97.33 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3070  ABC transporter, ATP-binding protein  96.89 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296088 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3248  putative ABC-type cobalt transport system, ATPase component  71.18 
 
 		 229 aa  344  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3315  putative ABC-type cobalt transport system ATPase  71.62 
 
 		 229 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3417  putative cobalt ABC transporter ATPase  74.06 
 
 		 218 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0943741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3312  putative ABC-type cobalt transport system, ATPase component  74.06 
 
 		 218 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3237  putative ABC-type cobalt transport system, ATPase component  73.58 
 
 		 218 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.953172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.92 
 
 		 568 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.82 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  36.92 
 
 		 568 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  36.32 
 
 		 582 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.93 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.48 
 
 		 280 aa  138  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.48 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3474  ABC transporter related  34.27 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.17 
 
 		 541 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1951  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.87 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  36.24 
 
 		 501 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  33.18 
 
 		 605 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  32.75 
 
 		 593 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.67 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.8 
 
 		 810 aa  129  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.13 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  34.65 
 
 		 348 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  29.82 
 
 		 280 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  29.82 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  31.88 
 
 		 568 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.58 
 
 		 574 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.73 
 
 		 286 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  28.82 
 
 		 288 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  36.41 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.67 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  31.78 
 
 		 593 aa  125  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1152  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00740539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  36.87 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  33.33 
 
 		 497 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  33.77 
 
 		 524 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  35.51 
 
 		 553 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.44 
 
 		 581 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.44 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  33.48 
 
 		 481 aa  123  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  35.89 
 
 		 373 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  31.78 
 
 		 509 aa  122  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  36.02 
 
 		 587 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  31.47 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0428  cell division ATP-binding protein FtsE  34.42 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  32.42 
 
 		 569 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  31.98 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4750  ABC transporter  34.88 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199681  normal  0.0424479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.37 
 
 		 281 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 276 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  28.57 
 
 		 284 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  33.66 
 
 		 764 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4174  cell division ATP-binding protein FtsE  34.42 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00105133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  32.16 
 
 		 366 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  32.27 
 
 		 564 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.03 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.9 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.14 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.36 
 
 		 579 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0355  cell division ATP-binding protein FtsE  34.42 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  31.47 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  35.71 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5110  cell division ATP-binding protein FtsE  34.26 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5336  cell division ATP-binding protein FtsE  33.95 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48090  Cell-division ATP-binding protein FtsE  34.42 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  31.86 
 
 		 343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  29.46 
 
 		 288 aa  118  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1803  cobalt transporter ATP-binding subunit  26.79 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  36.87 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  31.7 
 
 		 366 aa  118  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4983  cell division ATP-binding protein FtsE  33.95 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.92 
 
 		 373 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  32.07 
 
 		 372 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.47 
 
 		 581 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  33.48 
 
 		 283 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.81 
 
 		 354 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  28.5 
 
 		 283 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  30.99 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5160  cell division ATP-binding protein FtsE  33.95 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.59 
 
 		 395 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2723  hypothetical protein  34.42 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2596  hypothetical protein  34.42 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.92 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  34.33 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  35.68 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  30.45 
 
 		 286 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.01 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  33.19 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.45 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  30.74 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>