70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3250 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  88.44 
 
 		 524 aa  950    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  88.05 
 
 		 524 aa  946    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  81.01 
 
 		 519 aa  857    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  100 
 
 		 524 aa  1085    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  88.25 
 
 		 524 aa  946    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  88.25 
 
 		 524 aa  947    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  49.22 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  49.22 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  48.82 
 
 		 515 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  45.98 
 
 		 511 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  48.05 
 
 		 500 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  48.05 
 
 		 500 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  47.52 
 
 		 1156 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2254  lambda family phage portal protein  37.25 
 
 		 529 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.347018  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  26.11 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0733  Phage portal protein, lambda  26.28 
 
 		 487 aa  124  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.660834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1260  lambda family phage portal protein  27.11 
 
 		 494 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2897  lambda family phage portal protein  26.91 
 
 		 494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2048  lambda family phage portal protein  26.91 
 
 		 494 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2746  lambda family phage portal protein  26.87 
 
 		 494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1325  lambda family phage portal protein  26.87 
 
 		 494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2576  lambda family phage portal protein  26.87 
 
 		 494 aa  114  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2818  lambda family phage portal protein  26.87 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2822  lambda family phage portal protein  25.76 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  26.51 
 
 		 499 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  25.31 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  25.26 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  23.08 
 
 		 524 aa  100  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0857  bacteriophage-like protein  25.6 
 
 		 508 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  25.16 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  24.71 
 
 		 528 aa  94.4  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  24.71 
 
 		 528 aa  94.4  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  25.58 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  24.71 
 
 		 528 aa  92.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  23.57 
 
 		 537 aa  91.3  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  27.02 
 
 		 497 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  24.61 
 
 		 488 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  24.93 
 
 		 574 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1172  phage portal protein, lambda family  24.53 
 
 		 489 aa  86.7  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  25.07 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  26.98 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6669  phage portal protein, lambda family  24.15 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3860  phage portal protein, lambda family  25.4 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0281  phage portal protein, lambda family  24.04 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5773  phage portal protein, lambda family  24.72 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  25.37 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0808  Phage portal protein, lambda  24.47 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.343711  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  25.18 
 
 		 588 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  25.71 
 
 		 551 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  22.45 
 
 		 531 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0649  hypothetical protein  34.17 
 
 		 171 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1686  bacteriophage capsid protein-like protein  34.17 
 
 		 171 aa  74.7  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  23.66 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  23.37 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  24.6 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6598  lambda family phage portal protein  24.48 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  22.63 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  25.5 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1505  lambda family phage portal protein  22.7 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2308  lambda family phage portal protein  23.91 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0803517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  23.2 
 
 		 530 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  23.2 
 
 		 530 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2191  lambda family phage portal protein  22.89 
 
 		 497 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483953 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  22.8 
 
 		 530 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4684  lambda family phage portal protein  22.99 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1784  lambda family phage portal protein  22.75 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  22.87 
 
 		 530 aa  52  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0370  putative phage related protein  27.14 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  25.25 
 
 		 360 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  22.22 
 
 		 526 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>