209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2792 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  100 
 
 		 281 aa  584  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  68.02 
 
 		 250 aa  364  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  63.93 
 
 		 247 aa  358  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  63.81 
 
 		 261 aa  352  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  63.45 
 
 		 250 aa  351  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  64.2 
 
 		 261 aa  350  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  62.3 
 
 		 247 aa  350  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  64.34 
 
 		 255 aa  350  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  63.42 
 
 		 261 aa  349  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  62.93 
 
 		 263 aa  348  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  63.11 
 
 		 249 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  61 
 
 		 263 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  62.3 
 
 		 260 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  63.11 
 
 		 247 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  62.86 
 
 		 247 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  62.7 
 
 		 247 aa  332  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  56.23 
 
 		 285 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  61.07 
 
 		 247 aa  332  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  56.23 
 
 		 285 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  55.87 
 
 		 285 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  55.87 
 
 		 285 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  43.44 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  23.44 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  24.06 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  33.62 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  26.63 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  31.43 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  35.42 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  24.39 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  23.43 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  27.11 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  27.21 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  23.44 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  26.81 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  26.81 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  29.29 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  27.04 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  25.9 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.81 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.81 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.81 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  26.87 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  26.87 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.81 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  34.23 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.81 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  26.09 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  23.9 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  26.09 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  32.71 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.45 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 252 aa  52.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.71 
 
 		 259 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.36 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  22.94 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 199 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  23.81 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  26.09 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  32.38 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  32.38 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  32.38 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  32.38 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  32.38 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>